Stem Cells Int：生信分析揭示了调节人脂肪干细胞成骨分化的新关键基因
2019-09-03 不详 网络
脂肪干细胞（ASCs）是治疗许多人类疾病（包括骨质疏松症）的有吸引力的细胞来源。然而，解释ASC成骨的分子机制尚不清楚。首先从骨质疏松症患者的脂肪组织中分离出来ASCs。使用RNA测序（RNA-seq）比较成骨分化的ASC和未分化的ASC之间的整体转录组谱。然后，进行生物信息学分析以揭示调节ASCs成骨分化的中心基因和途径。选择一种感兴趣的基因C5AR1用于进一步研究。在具有成骨诱导和对照的ASC
脂肪干细胞（ASCs）是治疗许多人类疾病（包括骨质疏松症）的有吸引力的细胞来源。然而，解释ASC成骨的分子机制尚不清楚。
首先从骨质疏松症患者的脂肪组织中分离出来ASCs。使用RNA测序（RNA-seq）比较成骨分化的ASC和未分化的ASC之间的整体转录组谱。然后，进行生物信息学分析以揭示调节ASCs成骨分化的中心基因和途径。选择一种感兴趣的基因C5AR1用于进一步研究。在具有成骨诱导和对照的ASC之间鉴定了总共1521个上调基因和3020个下调基因。功能基因本体分析显示这些显着差异表达的基因（DEG）与细胞周期，蛋白质结合和核苷酸结合有关。通路分析显示，许多经典途径，如MAPK信号通路和PI3K-AKT通路，可能积极参与调节ASCs的成骨分化。通过蛋白质-蛋白质相互作用分析鉴定了总共三个子网络和20个中心节点。此外，在ASCs的成骨分化过程中，C5AR1的表达水平明显增加。C5AR1的下调显著降低了成骨分化生物标志物的表达水平和钙结节形成能力。
总的来说，我们提供了许多新的基因和途径，这些基因和途径可能是ASC成骨分化不可或缺的。操纵该候选基因的水平可能有助于骨质疏松症治疗。
原始出处：
Cheng J, Zhao X, et al., Bioinformatic Analysis of Transcriptomic Data Reveals Novel Key Genes Regulating Osteogenic Differentiation of Human Adipose Stem Cells. Stem Cells Int. 2019 Jul 31;2019:1705629. doi: 10.1155/2019/1705629. eCollection 2019.
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