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印度现双重变异,波及190国疫苗交付

2021-03-25 JACKZHAO MedSci原创

印度政府高级官员周三表示,印度已在受灾最严重的西部州马哈拉施特拉邦(Maharashtra)的206个样本中检测到新型冠状病毒的“双重突变体”。

2.jpg印度总理莫迪正在接种新冠疫苗。(图:NYT)

3月24日,印度国家疾病控制中心主任苏吉特·库马尔·辛格(Sujeet Kumar Singh)在新闻发布会上表示,印度政府在马哈拉什特拉省(Maharashtra)206个患者的样本中,发现新冠病毒(SARS-CoV-2)新变种病毒株,这病毒株存有双重变异,或将弱化疫苗免疫效果且传染性更强,导致当地疫情恶化。

印度疫情概况,JHU

双重突变病毒株同时出现E484Q及L452R突变。而与2020年12月的情况相比,印度有双重突变病毒株的样本比例有所上升。之前在马哈拉施特拉邦已经检测到E484Q突变,在加利福尼亚州的患者中发现了L452R,此类突变可带来免疫逃逸,有研究发现能够使病毒具有更高的传播力。

Distribution of silent (green triangles) and amino acid (red triangles) mutations across region 414-583 of the Spike protein. Dark red – receptor-binding domain (RBD); Green – C-terminal domain 1 (CTD1) of S1 Spike region; Blue – receptorbinding ridge epitope residues; Yellow – 443-450 loop epitope residues; Black – 570-572 loop residues.

突变在Spike蛋白区域414-583中的分布

印度卫生官员们正在进一步研究该突变病毒中两个突变同时出现的变异体是否更具感染性与对现有疫苗的影响。印度SARS-CoV-2基因组学联盟(INSACOG)对来自印度18个邦的约10787个样本进行检测,结果也发现771例已知变体,其中英国变种736例,南非变种34例,巴西变种1例。据报道,在新德里也发现了9个这种新变异病毒的样本,当地的感染病例在过去几周持续上升,印度周三报告47262例病例,其中275人死亡,这是今年以来最大的每日上升。但官员说,这些变种与印度病例激增没有关系。

Tchesnokova V et al. 2021. Acquisition of the L452R mutation in the ACE2-binding interface of Spike protein triggers recent massive expansion of SARS-Cov-2 variants. BioRxiv.doi: https://doi.org/10.1101/2021.02.22.432189https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2021.02.22.432189v1

Tchesnokova 等的发表的预印版研究证明了L452R突变在病毒适应性进化中的重要性。特别观察到对L452R突变的强阳性选择,这表明病毒的适应性进化可能是对广泛的遏制措施或对原始病毒株增加的群体水平免疫力的反应。

印度SARS-CoV-2基因组学联盟(INSACOG)是印度卫生部下属的10个国家实验室组成的小组,对最新样品进行了基因组测序。病毒发生突变很普遍,但大多数都微不足道,不会引起传播或严重感染的能力发生任何变化。但是某些突变,例如英国或南非变异谱系中的突变,可使病毒更具感染力,在某些情况下甚至更致命。

Study: Acquisition of the L452R mutation in the ACE2-binding interface of Spike protein triggers recent massive expansion of SARS-Cov-2 variants. Image Credit: Design_Cells / Flickr

印度病毒学家沙希德·贾米尔(Shahid Jameel)解释说:“病毒S蛋白关键区域的双重突变可能会增加这些风险,并使病毒逃脱免疫系统”。他补充说,这些基因变异可能会令人担忧,因为它们可能有助于病毒更容易传播并逃脱免疫系统,但他告诫不要将其与激增联系起来。

印度国立免疫学研究所的Vineeta Bal博士说,目前种宽松政策和缓慢疫苗接种是最令人担忧的。卫生部在一份声明中说,在从马哈拉施特拉邦测序的样本中有15%-20%发现了这种变异。该邦是印度金融之都的所在地,该邦最近遭受的疫情冲击最为严重,占印度所有新冠病例的60%以上。同时,卫生官员承认他们担心即将到来的节日-荷丽节(Holi),其中许多节日标志着春天的来临。印度政府已写信给各州,考虑施加公共卫生行动限制,但许多名人违反了病毒社交疏离规定。新德里、孟买、古茶拉底省等多地政府已明令禁止荷丽节(Holi)庆祝活动,印度民航总局也宣布把国际航班禁令延长到4月30日。

印度疫情加剧波及190国疫苗交付

如果疫情持续的时间越长,印度发生超级变种的可能性就越大。印度已暂时搁置了世界最大的疫苗生产商印度血清研究所(SII)生产的阿斯利康疫苗出口,以满足国内需求,以缓解疫情。此举或将影响延迟由全球疫苗和免疫联盟/世界卫生组织支持的全球COVAX疫苗共享计划的供应,该计划将使64个低收入国家从SII获得疫苗。COVAX正在与印度政府进行谈判,以确保尽快交货。

全球最大疫苗制造商产能不足,印度的疫苗承诺成了信口开河

印度外交部和SII均未回复置评请求。迄今为止,COVAX已从SII接收了1770万剂阿斯利康疫苗,印度总共已运送了6050万剂,许多国家都依靠该计划为公民接种疫苗。

知情人士称,印度疫情局势未稳定前,疫苗出口现状将不会有很大改变。

事实上,SII已经推迟了阿斯利康疫苗向巴西,英国,摩洛哥和沙特阿拉伯的装运。印度外交部网站显示,自从上星期四以来,印度没有疫苗出口,因为该国扩大了自己的免疫接种工作。英国当局正在与新德里取得联系,以从SII订购第二批500万剂。COVAX已达成协议购买SII批量生产的11亿剂阿斯利康和Novavax疫苗,主要用于中低收入国家。

据路透社报道,联合国儿童基金COVAX已经告知参加国,他们在三月份在韩国生产的阿斯利康疫苗产量将低于预期。它说:“与当前全球供应环境的挑战相一致,这是由于公司在迅速扩大供应和优化这些早期交付的生产流程方面所面临的挑战。”

Covid-19 vaccine update: SII seeks Govt's nod to give 50 lakh Covishield  doses to UK, says won't affect India's vaccination drive - The Financial  Express

此前,印度药品管理总局批准了两种新冠疫苗在印紧急使用。自2021年1月6日正式启动的印度新冠肺炎疫苗普及计划,原计划到8月份时完成为3亿人接种疫苗的任务。印度政府宣布将从4月1日开始,为该国45岁以上人群接种新冠疫苗。印度政府官员还敦促称,所有符合条件的人都应立即注册并接种疫苗。目前,印度已接种超过5200万剂,其中4700万剂是SII的阿斯利康本地生产疫苗。 其余的是巴拉特生物技术公司在印度开发的COVAXIN疫苗。政府已要求SII提供约1.41亿剂。

这意味着几乎占印度疫苗出口的全部。据路透社本月初报道,SII计划从4月/ 5月起将月产量从现在的7000万剂增加到1亿剂。

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