Blood：遗传-转录组学分析明确关键转录因子是人红白血病的驱动因素
2020-05-12 QQY MedSci原创
急性红细胞白血病(AML-M6或AEL) 是一种罕见的侵袭性血液恶性肿瘤。既往研究表明，AEL白血病细胞通常携带已知的AML相关癌基因的复杂核型和突变。
急性红细胞白血病(AML-M6或AEL) 是一种罕见的侵袭性血液恶性肿瘤。既往研究表明，AEL白血病细胞通常携带已知的AML相关癌基因的复杂核型和突变。
为了更好地定义驱动红系表型的潜在分子机制，研究人员对33例AEL样本系列进行研究，这些样本代表了AEL的三个遗传亚组，包括TP53突变、表观遗传调控子突变（如DNMT3A、TET2或IDH2）和未定义的低突变负荷的病例。
研究人员建立了一个基于红系 vs 髓系的转录组学的“空间”，在该“空间”中，与上述分子亚组无关，大多数AEL样品表现出与非M6 AML和骨髓增生异常综合征样品不同的独特定位。值得注意的是，超过25％的AEL患者（包括在基因上不确定的亚组中）显示出关键转录调节因子的异常表达，包括SKI、ERG和ETO2。这些因子在小鼠红系前体细胞中的异位表达阻碍了红系体外分化，导致永生化，与GATA1结合位点的染色质可及性降低以及对GATA1活性的功能干扰有关。
体内模型显示，致命的红系、红系/髓样混合或其他恶性肿瘤的发生，取决于表达AEL相关变异的细胞群。
总而言之，本研究提示，AEL是一种具有红系同一性的分子异质性疾病，部分原因是造血干细胞或祖细胞中关键的红系转录因子的异常活性。
原始出处：
Alexandre Fagnan，et al. Human erythroleukemia genetics and transcriptomes identify master transcription factors as functional disease drivers. Blood. April 29， 2020.
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