Clin Chem:血浆线粒体DNA拓扑分析显示线状和环状分子共存
2019-10-19 gladiator MedSci原创
细胞线粒体DNA (mtDNA)的结构为环状、共价闭合和双链DNA。研究表明,血浆中存在短mtDNA片段。目前尚不清楚环形线粒体DNA是否与线性线粒体DNA均存在于血浆中。
细胞线粒体DNA (mtDNA)的结构为环状、共价闭合和双链DNA。研究表明,血浆中存在短mtDNA片段。目前尚不清楚环形线粒体DNA是否与线性线粒体DNA均存在于血浆中。
研究人员利用限制性内切酶BfaI在线粒体DNA片段末端的裂解特征,对血浆线粒体DNA的拓扑结构进行分析,以区分线状和环状的线粒体DNA。两端携带BfaI裂解标志线粒体DNA片段被定义为环形衍生线粒体DNA,而那些没有裂解标志或具有1个裂解标志的被定义为直链衍生的mtDNA。采用独立的外切酶V法去除线性DNA,酶切酶MspI法验证了基于BfaI裂解分析的结论。通过对肝移植和骨髓移植患者的血浆DNA进行测序,我们分析了非造血和造血源DNA分子中血浆DNA末端BfaI切割特征。
研究显示,血浆中同时存在线状和环状线粒体DNA。在肝移植患者中,供体来源(即供体来源)mtDNA分子以线性为主(中位分数,91%;范围:75%-97%。mtDNA分子以环形为主(中位分数88%;范围内,77% - -93%)。血浆DNA中线性mtDNA比例与肝脏DNA贡献呈显著正相关(r = 0.83;P值= 0.0008)。从骨髓移植接受者中及其供体来源获得一致的数据,因为供体的mtDNA分子主要是环形的。
研究表明,线状和环状的线粒体DNA分子在血浆中共存,但可能具有不同的组织来源。
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