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Front Pharmacol:基于网络药理学、生物信息学和验证实验的石斛提取物对胰腺导管腺癌的综合分析

2023-03-22 紫菀款冬 MedSci原创 发表于上海

应用网络药理学、生物信息学、体外实验等方法,探讨了石斛有效成分石斛酚(Dendrobin A)对胰腺导管腺癌(PDAC)的作用及机制。

背景:石斛(Dendrobium nobile, D. nobile)是一种中草药,作为抗肿瘤药物受到了广泛关注,但其作用机制尚不清楚。该研究应用网络药理学、生物信息学、体外实验等方法,探讨了石斛有效成分石斛酚(Dendrobin A)对胰腺导管腺癌(PDAC)的作用及机制。

方法:利用SwissTargetPrediction和PharmMapper数据库获取Dendrobin A的潜在靶点,并从The Cancer Genome Atlas和Genotype-Tissue表达数据库中获取PDAC与正常胰腺组织之间的差异表达基因(DEGs)。基于STRING数据库构建了Dendrobin A抗PDAC靶标的蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络。分子对接法评价Dendrobin A抗PDAC靶点。

PLAU是Dendrobin A抗PDAC的关键靶点之一,在临床组织阵列中进行免疫组化染色。最后,通过体外实验验证Dendrobin A对PLAU表达及PDAC细胞增殖、凋亡、细胞周期、迁移和侵袭的影响。

结果:共筛选出90个Dendrobin A抗PDAC基因,构建了Dendrobin A抗PDAC靶点的PPI网络。值得注意的是,PPI中有19个基因的无标度模块表明PPI具有较高的可信度。在这19个基因中,PLAU与PDAC患者恶病质状态呈正相关,与PDAC患者总生存期呈负相关。

通过分子对接,发现Dendrobin A与PLAU结合,Dendrobin A处理导致PDAC细胞PLAU表达减弱。基于临床组织阵列,与正常对照相比,PLAU蛋白在PDAC细胞中高表达,并且PLAU蛋白水平与PDAC的分化和淋巴结转移状态相关。体外实验进一步表明,Dendrobin A处理显著抑制PDAC细胞的增殖、迁移和侵袭,诱导细胞凋亡,并在G2/M期阻滞细胞周期。

结论:Dendrobin A可以PLAU为靶点,有效对抗PDAC。该研究结果为未来基于石斛的PDAC治疗提供了基础。

原始出处:

Xu X, Yu Y, Yang L, et al. Integrated analysis of Dendrobium nobile extract Dendrobin A against pancreatic ductal adenocarcinoma based on network pharmacology, bioinformatics, and validation experiments. Front Pharmacol. 2023;14:1079539. Published 2023 Mar 1. doi:10.3389/fphar.2023.1079539

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    2023-03-22 侠胆医心 来自上海

    基于#网络药理学##生物信息学#和验证实验的#石斛#提取物对#胰腺导管腺癌#的综合分析

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